牙龈肿痛、扁桃体发炎的原因，可由成因和病原体划分为以下几种：
1、成因：可能是牙齿发炎，从而波及到扁桃体，两者是邻居关系。另外也可能是扁桃体的炎症，波及到口腔的牙齿，引起牙龈肿痛；
2、病原体：可由病毒感染引起，俗称的感冒，即上呼吸道感染。另外也可以由细菌感染引起，如牙龈炎，特别是智齿发炎，智齿冠周炎得不到控制，可能会向咽腔、扁桃体区播散，从而引起扁桃体炎。化脓性扁桃体炎可以扩展到扁桃体周围炎，从而向前播散，引起牙龈肿痛。
若 出现牙龈肿痛，同时伴有扁桃体发炎的症状，通常不建议在自行在家处理，应尽快到专科医院就诊。可以到口腔科，检查牙齿是否存在着相应的问题，特别是智齿，也可以到耳鼻喉科，检查扁桃体，排除扁桃体周围炎和扁桃体周围脓肿。