多囊卵巢综合征患者可以在月经周期的任何时期做检查。患者可因排卵障碍，表现有月经失调，出现月经频发、月经稀发或处于闭经状态，此时并非一定要在早卵泡期进行检查。
若患者已经数月没有来月经，可以检查生殖激素六项，观察有无排卵或处在哪一卵泡期。若患者月经来潮45天或更长时间，也可以做激素六项检查了解上述情况。如果已口服数月短效口服避孕药，此时做激素检查，可以选择在早卵泡期，即月经来潮后的2-5天。因此时可根据激素变化，初步判断停用避孕药后月经能否恢复，即卵泡排卵能否恢复。
若激素水平异常，可以继续用避孕药调整，或停用避孕药后有生育要求，可在月经期时口服或肌注药物促排卵，帮助优势卵泡产生，再进行排卵监测，以指导同房。所以多囊卵巢综合征患者月经不规律时，激素水平可选择在任何时期检查。