喉镜和胃镜的难受程度不同，胃镜会更难受。喉镜从鼻腔内插入，而且镜子较细，只到喉部。过鼻腔时患者有一种酸胀感，而没有呕吐感。酸胀感可以克服，而且难受程度也不明显。
但是做胃镜不同。做胃镜要从口腔进入，经过食道。常规胃镜直径为1cm，比大拇指粗。胃镜检查时相当于异物插到食道，患者会难受。因为要克服异物感，即将异物呕出，呕吐过程中患者会难受。
少数患者能克服呕吐的感觉，难受程度会下降。但是多数患者较难做到这一点。因此，多数患者做胃镜时会难受，提倡做无痛胃镜，用麻药控制患者呕吐反射。做喉镜不需要麻醉，因为只是酸胀感，容易克服。