丙型肝炎阴性并不一定没有丙型肝炎，需要根据患者检测的项目，以及检测的时间进行判定。检测丙型肝炎丙型肝炎的抗体，即抗-HCV，以及丙型肝炎的核酸，称为HCV-RNA。具体二者所代表的意义如下：
1、丙型肝炎的核酸：是检测丙型肝炎在患者体内是否出现丙型肝炎的病毒复制，以及是否传染的标志。一旦体内被丙型肝炎病毒感染，在患者发病后1-3周，即可出现丙型肝炎的核酸阳性。所以此时如果出现丙型肝炎核酸阳性，可以考虑患者体内已经丙型肝炎病毒存在，而且丙型肝炎病毒复制是传染性指标，丙型肝炎核酸滴度越高，传染性越强。如果患者经过治疗后，丙型肝炎的核酸很快转阴 ，以及持续转阴，但此时还无法检测，包括患者在口服抗病毒药治疗后，使用标准疗程12周治疗后，要停药观察12周，如果还持续阴性，才能说明体内丙型肝炎病毒被清除；
2、抗-HCV：即在丙型肝炎病毒感染2周之后，甚至1个月-3个月才出现阳性，出现较晚，所以需要丙型肝炎病毒感染之后，在很早时患者如果检测阴性并不能代表没有感染过丙型肝炎病毒，所以要动态观察。丙型肝炎抗体阳性只代表体内有丙型肝炎病毒感染，抗体不具有保护性，所以可以终身携带或者长时间携带。
所以部分患者在经过抗病毒治疗后，核酸出现阴性，而检查抗体时仍然阳性，怀疑自己是否出现丙型肝炎复发。其实是否出现丙型肝炎复发，以及病毒是否被清除，主要需要观察HCV-RNA是是否阴性。因为丙型肝炎抗体不具备判断丙型肝炎是否被体内被清除的标志，以及体内是否有传染性、病毒是否复制的指标，丙型肝炎抗体阳性只代表感染过丙肝病毒。