治疗尿β2-微球蛋白偏高主要是找到原因，然后给予对因治疗，主要原因是肾小管功能受到损伤。
β2-微球蛋白因为是小分子蛋白，可以从肾小球滤过到原尿中。经肾小管重吸收后，绝大多数的β2-微球蛋白就会被重吸收回血液。只有小部分的β2-微球蛋白会从尿中排出，一般检测不到。
如果能检测到β2-微球蛋白就说明β2-微球蛋白升高。一般反应的是肾小管的重吸收能力下降，大多数和滥用中药、保健品等有关。
通常会提醒病人不用不明来源的中药，尽量不用保健品，尽量 不要用草药、土方。另外也要避免滥用抗菌素、止疼药，可避免对肾脏的肾小管造成伤害。
如果尿中的β2-微球蛋白升高，这时主要观察有没有肾小管的疾病。如果有上述情况，要注意尽可能避免外源性因素导致肾小管损伤。