射精时疼痛，考虑是泌尿系统、生殖系统感染引起。细菌从尿道口进入到尿道、前列腺、精囊腺、膀胱等部位，可引起局部黏膜及射精管道损伤，尿液或精液经过时会出现明显疼痛症状，同时可能伴有尿频、尿急、尿不尽，甚至血尿、发热、寒战等症状。部分患者会出现血精，是指精液中含有血性血块，需要进行尿常规、精液常规、前列腺液常规、泌尿生殖道B超以明确诊断，查明严重程度。
如果是轻微感染，通过多喝水、多排尿，使用广谱抗生素如头孢二代，三代或者喹诺酮类药物等治疗一周左右，症状可以明显缓解。射精疼痛 合并血精状态时，考虑精囊炎症较重，甚至精囊腺内有精囊结石的出现。患者常规使用药物治疗无效后，可以使用精囊镜通过微创技术进入精囊，将炎症和结石清除后达到治疗目的。