新生儿六指的最佳切除时间，需根据具体类型决定。具体如下：
1、赘生指：新生儿的第六指与正常指骨或手掌之间没有骨骼连接，仅靠血管和软组织连接，此情况为赘生指。需在孩子出生后尽早切除，主要由于容易发生坏死。若指端变黑甚至出现溃烂，需要尽快进行急诊手术，避免感染和坏死范围扩大，影响新生儿的健康；
2、有骨性连接的多指：一般建议1-3岁进行切除，1岁以后主要考虑 孩子的麻醉安全，3岁以前主要考虑孩子在进入幼儿园前，尽量将异常的多指切掉，避免影响孩子的心理发育；
3、多病指：在第六指与正常的指骨之间，存在大量皮肤软组织连接的情况下，切除多指的同时，需进行植皮手术，但需考虑新生儿是否有充足的皮缘可以供应局部手术。当孩子满足上述手术条件时，才能考虑进行多指切除和皮肤移植。