甲状腺癌手术全身麻醉与头疼无直接关系，若患者术后出现头疼，尤其剧烈、持续的头疼，要注意是否存在其它并发症。需进行生命体征的监测，即血压、心率，同时要了解患者的基本状况、是否有高血压病或相关药物的使用情况，需严防发生蛛网膜下腔出血等神经系统疾病。若患者头疼持续存在，需要请相关科室，如神经内科或外科协作处理。
此外，做甲状腺癌手术时需把肩部垫高，头尽量后仰，部分患有颈椎疾病的患者，长时间手术时可能造成颈椎曲度的变化，可能引起颈椎病发作，从而引起头疼。所以在严密监测的同时，要判断患者头痛的性质和程度，并针对性的 进行处理。