嘴角小水疱的致病因素较多，且较复杂，可分为口腔局部因素以及全身因素，具体原因如下：
一、口腔局部因素：
1、细菌感染：应确定其致病因素，针对相应的口腔感染因素给予治疗。对于龋病，应及时去龋，在进行冲洗、消毒、隔湿、吹干后进行相应的充填修复；对于牙髓炎及根尖周炎，应进行根管治疗；对于牙周炎及牙龈炎可进行全口洁治等；
2、病毒感染：应给予抗病毒的药物，对症积极治疗。将感染控制住，则嘴角出现小水泡的症状也可以得到相应解决。
二、全身因素：
可能由于全身系统性疾病，以及患者免疫力下降等各种因素 所造成。此时需加强免疫力，并且给予全身系统疾病的治疗。