新生儿分流如果手术时机掌握比较好，90%以上患者对认知的影响非常有限，甚至没有影响。因为人脑在胎内是发育过程中，出生之后延续胎内发育过程。尤其是新生儿，一旦发现脑积水，尽早处理之后，对于脑发育环境较大改善，从而为再次发育创造比较良好条件。
据临床观察，大部分90%以上病人其实在长大之后，6-7岁或10多岁读书之后，对认知影响非常有限。大部分病人在日常生活中，根本观察不到新生儿期做过手术，而且身上还埋一根分流管。所以总体来讲，对于认知、其它运动、语言、全身功能，新生儿分流之 后大部分预后良好，没有后遗症。