男性生殖器疱疹通常由单纯疱疹病毒2型引起,但单纯疱疹病毒2型和单纯疱疹病毒1型都可能引起生殖器疱疹。
研究调查显示,约80%-90%的生殖器疱疹由单纯疱疹病毒2型引起,约10%-20%的生殖器疱疹由单纯疱疹病毒1型引起,同时调查发现,约80%-90%的口唇周围疱疹由单纯疱疹病毒1型引起,所以这两种病毒和疾病之间存在一定程度的交叉性。
生殖器疱疹多由单纯疱疹病毒引起,但其它原因也可导致生殖器疱疹,如外阴部位的带状疱疹病毒,但其诊断为带状疱疹,而非生殖器疱疹。