眼睛上长个小疙瘩需要根据具体疾病进行不同处理，常见疾病如下：
1、霰粒肿：即毛囊堵塞，尤以上眼皮多见，摸起来如痘样、囊肿样，此时需进行热敷。若热敷未起效，肿块边界清楚，若小孩或成年人能够配合手术，可在门诊点麻药后，挑起来用刀片划开，使用小刮勺进行清理。若为不配合的儿童，同时眼睛上疙瘩较多、时间较长、个头较大，或疙瘩本身出现破溃表现，可考虑在麻醉状态彻底清理，麻醉属于较安全的技术，很少出现问题，麻醉比局麻相对复杂，需根据严重程度进行评估；
2、麦粒肿：可考虑切开排脓；
3、传染性软疣：通常无需处理，若生长较大时可用夹子夹碎，需通常眼科医生进行评估，确定手术治疗的施行与否。