引起眼底新生血管原因较为复杂，特别是黄斑变性导致眼底新生血管形成的原因目前仍在研究中，可能与遗传有关，在检测基因时会发现患者均存在基因突变。虽然可能与遗传有关，但由于受到多种因素影响，所以父母患病时儿童并不一定会被遗传。
局部炎症、缺血、缺氧甚至叶黄素以及锌缺乏均可能导致黄斑变性，而长期高浓度、高频度紫外线照射也是诱发黄斑变性的原因。所以患者需要避免紫外线照射，减少局部炎症刺激，避免缺血、缺氧，从而预防黄斑变性。但上述预防措施并不能避免黄斑变性发生，一旦发生应进行积极治疗。
此外，糖尿病视网膜病变患者由于高血糖、高血压、高血脂导致血管闭锁，而在发生血管闭锁后，局部缺血、缺氧会刺激视网膜产生新生血管。此时应及时进行眼底激光治疗或抗新生血管的眼内注射治疗，从而消除新生血管。