系统性红斑狼疮是比较危重的疑难杂症，首选药物较难明确，目前多数患者都会选用糖皮质激素，如醋酸泼尼松、甲泼尼龙等激素类药物。但不一定所有患者都会选用，虽然系统性红斑狼疮损害多个系统，但部分患者因为疾病分期不同，可能诊断后无明显内脏损害，会先用硫酸羟氯喹等药物，少量使用皮质激素，所以系统性红斑狼疮可能没有首选药，更没有特效药。
系统性红斑狼疮的患者需到正规医院明确诊断、完成病情评估，判断系统性红斑狼疮损害到的系统，如皮肤、神经系统、肾脏、关节、血液系统等，并分析预后不良因素，即内 脏损害到何种程度。再根据上述情况确定药物，不能回答一个药物就用该药物治疗。