阿昔洛韦和伐昔洛韦都属于抗病毒药物，这两种药物的主要区别在药物吸收方面。伐昔洛韦是阿昔洛韦的前体药物，伐昔洛韦进入人体后，会代谢为阿昔洛韦和缬氨酸。伐昔洛韦的结构改造，使其与阿昔洛韦相比有更高的生物利用度，伐昔洛韦的生物利用度可达45%，而阿昔洛韦的生物利用度通常是15%-30%。
在作用机制、临床应用以及药理学作用方面，这两种药物没有明显差别，都属于抗病毒药，主要通过对DNA多聚酶的抑制作用，从而抑制病毒复制，阻止DNA链的延伸，起到抗病毒功效。这两种药物主要针对单纯疱疹病毒、带状疱疹病毒有较好的抗病毒效果，对巨细胞病毒也 有一定作用。
总之这两种药物最主要的区别在于伐昔洛韦是阿昔洛韦的前体药物，生物利用度可能高于阿昔洛韦。