甲状腺结节穿刺的操作时间不长，通常在10-20min即可完成。甲状腺结节穿刺的操作目的是为了明确甲状腺结节的性质，是良性还是恶性。操作通常不需要到手术室进行，在B超室即可。B超医生对甲状腺结节病变的位置和深浅做定位，并在患者的体表做标记。
操作的通常是普外科医生或甲乳外科医生，先局部进行清洁、消毒，注射局部的麻醉药物，减少操作时所带来的不适、疼痛感觉。甲状腺穿刺通常用10mL的注射器，即医学所指的细针穿刺，通常穿刺3-5次，获得足够量的甲状腺结节的组织，送到病理科，病理科医生会做进一步的化验，给出明确的病理诊断报告。整个操作过程患者在局麻下，耐受非常好，患者不必恐惧手术时间过长或会造成疼痛。