肾炎患者吃他克莫司的时候出现尿路感染，需要根据实际情况来进行判断，因为尿路感染有轻有重，有上尿路感染、下尿路感染，具体处理如下：
1、继续使用他克莫司：如果是下尿路感染，或比较轻微的上尿路感染，即轻度肾盂肾炎或膀胱炎。不管是急性膀胱炎，还是慢性膀胱炎，只要体温未升高，在正常范围内，这时并不需要停用他克莫司，需要对抗引起泌尿系统感染的病原微生物，多喝水，服用小苏打来碱化尿液，同时应用改善尿路感染的药物，如银花泌炎灵或热淋清等。如果没有禁忌证，最佳抗病原微生物的药物是喹诺酮类药物，＜18周岁或哺乳期、孕期妇女或恶性高血压、神 经系统病史的患者不能服用喹诺酮类的药物，此时β-内酰胺类药物或大环内酯类抗生素是最佳的选择；
2、停止使用他克莫司：如果肾炎患者服用他克莫司的时候，出现比较严重的尿路感染，如比较严重肾盂肾炎，体温升高，特别是体温＞38.5℃的时候，这时以上的对症治疗外，应用抗病原微生物药物，需要暂时停用他克莫司，当泌尿系统感染控制以后，再加用他克莫司来治疗肾炎。