甲状腺非典型滤泡上皮细胞一般是指在甲状腺穿刺细胞学检查时的一个病理学术语，较常见，通常提示这个患者甲状腺恶性肿瘤的可能性有10%-30%。
患者这次穿刺不能十分明确提示有恶性的可能，可以间隔一段时间，一般3个月后再进行穿刺。第二次穿刺有可能会获得明确的结果，但是也有一定的比例，比如20%-25%的患者仍然不能明确，还是报告甲状腺非典型滤泡上皮细胞。
如果患者特别焦虑，在这种报告情况下，可以直接进行手术，把甲状腺一部分切掉，切掉后送病理学检查，这种检查较准确。甲状腺肿瘤大多数情况下预后良好，如果患者不是特别焦虑， 可以定期复查。也可以做基因检测，比如做甲状腺的BRAF基因或者RAS基因检测，也能帮助诊断。
因此，出现甲状腺非典型滤泡上皮细胞，目前不能确定这个是良性还是恶性，有一定的恶性比例。