药物流产第3天要给予米索前列醇，通常给药后数小时可以看到孕囊排出，排出的孕囊一般表现为在血块中有一团白色肉状物，孕囊放到清水中会看到周围有一团毛茸茸的组织。药物流产第3天排孕囊阶段要在医院观察，排出组织物需要医生进行判断，根据专业知识判断是否为孕囊。大部分情况下药物流产第3天可以看到孕囊排出，说明药流暂时成功。
如果当时看到孕囊排出，一般2周后复查B超，除外胎膜或者孕囊周围组织残留，如果有残留，有时也需要清宫，但概率一般<10%。如果药流当天没有看到明显孕囊排出，要给予充分的观察时间，一般要回家观察1周左右的时间，1周之后再复查B超，因为随时都有孕囊排出的可能，1周后复查B超如果仍然有残留，这时才需要手术清宫。