胚胎性大脑后动脉不存在危害，它没有危害。人脑主要有4根血管供血，第一有2根颈内动脉，第二有后椎动脉、椎基底动脉。
颈内动脉到颅内以后，分为大脑中、大脑前，椎基底动脉系统包括大脑后动脉，大脑后动脉和前循环，会有一个后交通动脉。胚胎性大脑后动脉，一般指血管比较粗，掩盖了后交通，只要患者的血供，没有明显受影响，即患者没有表现为经常头晕，也没有动脉瘤，它只是一种发育的正常差异，并没有产生什么特别的危害。通常有危害的颅内动脉，主要是指颅内动脉瘤、颅内血管畸形。
所 以，胚胎性大脑后动脉，只是一种血管的描述、发育的不同，它并没有危害。