对于婴儿大脑发育不良的治疗，要具体情况具体分析，应先分析导致其出现大脑发育不良的原因，再采取相应措施，具体如下：
1、脑瘫：此时大脑发育不良并非进行性病变，所以治疗上通常主要采取康复训练，先对婴儿整个神经系统进行详细评估，从而针对性进行康复训练。此外可以配合药物以及特殊的生物治疗，通过上述康复训练、药物和生物治疗，婴儿的脑功能会逐渐得到改善；
2、先天性脑积水：需要及时领婴儿到脑外科就诊，查头部CT或者核磁共振明确诊断，如果病情需要的情况下，需要到脑外科进行手术治疗。当脑积水得到缓解后，再对于婴儿的大脑功能进行相应的康复训练，其功能会逐渐追赶达到正常孩子或接近正常孩子的水平；
3、先天性遗传代谢疾病：此时没有特效的治疗方法，主要是对症进行康复训练。