强直性脊柱炎是不能自愈的疾病，强直性脊柱炎的发病规律是反复的病情缓解和复发的过程，有些患者在病情缓解后，很长时间不会发作炎症。但在肠道感染、泌尿道感染等诱因的情况下，会诱发强直性脊柱炎的炎症再次活动，逐渐引起强直性脊柱炎终末期的病变，即新骨形成、骨桥形成，导致关节强直，甚至可以引起驼背和残疾。
强直性脊柱炎是慢性复发的过程，所以对于此类患者，要进行终生随访和治疗。如果有很明显的炎症情况，会给予非甾体抗炎药，甚至生物制剂，主要是使用肿瘤坏死因子拮抗剂来控制强直性脊柱炎的炎症发作。
要定期检查强直性脊柱炎患者的X线光变化，明确有没有新骨形成的趋势。目前在市场上还有白介素-17A的生物制剂，对强直性脊柱炎的新骨形成有很好的抑制作用。