由于植物神经紊乱涉及的范围比较广，临床主要涉及的有循环系统、消化系统以及内分泌系统，所以，植物神经紊乱的药物治疗之前，首先要经过一些实验室检查以及相关的辅助检查，排除循环、消化以及内分泌系统的器质性病变之后，再进行植物神经紊乱的药物治疗，包括以下一些药物治疗：
1、调节植物神经功能的药物，如谷维素、维生素B₁、养血清脑颗粒、心神宁片、安神补脑液等；
2、对于病人出现的各种不同症状，如心悸、胸闷、心慌、气短等，可以应用普萘洛尔、美托洛尔，对于心慌的患者，也可以应用一些小剂量的心得安(普萘洛尔)；
3、对于由于胃肠功能紊乱导致的，可以出现腹痛、腹泻、便秘，可以应用多酶片或胃蛋白酶；
4、一部分血压异常的患者，可以出现低血压或高血压，对于低血压的患者，可以口服生脉饮，对于高血压的患者，不要轻易自己随意吃药，建议到医院进行监测血压，由专业医师进行调治治疗；
5、失眠的患者，睡前可以服用一些苯二氮䓬类的镇静药物，如地西泮、艾司唑仑等；
6、对于由于焦虑、抑郁导致的焦虑、抑郁状态，可以应用黛力新(氟哌噻吨美利曲辛片)或米氮平来缓解症状。