深度龋齿可以补牙，深度龋齿在临床上叫做深龋，指细菌已经侵入到牙本质深层，当细菌侵入到牙本质深层后，往下发展会引起牙髓发炎。深龋时进行修复治疗比较重要，如果发生深龋时，应在局麻下去除腐质，也就是已经坏死的物质，露出干净的组织后，可以对窝洞消毒。消毒后应进行垫底，可以用氢氧化钙间接盖髓，也可用玻璃离子垫底，然后再进行树脂充填。通常深龋充填后，不会引起牙髓炎或根尖周炎。
部分情况下将深部龋齿修补后会出现疼痛，可能是牙体充填材料刺激，也可能是深龋过深已波及到牙髓，去除腐质时有少量牙髓露出，在进行牙体充填时没有进行垫底，直接用树脂进行充填，树脂对牙髓产生刺激引发疼痛。深度龋齿应进行修补，且要2-3层进行垫底充填，避免刺激牙髓，阻止龋齿进一步发展。