碘伏擦鼻孔一般并没有明显的不良影响或者也没有治疗疗效，通常也没必要。除非局部皮肤有感染迹象，可以适当用碘伏消毒，但一般局部皮肤没有特殊原因，也不会感染。
有一种情况就是反复抠鼻子、揉鼻子会造成鼻黏膜以及鼻腔前庭皮肤损伤，如导致鼻前庭炎，这时会有一些疼痛以及鼻前庭内结痂。此种情况下可以用碘伏适当消毒，并且在消毒后可以局部涂抹抗生素软膏，如百多邦(莫匹罗星软膏)，一般连续涂抹5-7天就可以获得比较好的效果。
当然，鼻前庭炎主要原因就是和反复抠鼻子、揉鼻子以及拔鼻毛等刺激有关，所以平时还是 要尽量避免抠鼻子、揉鼻子以及拔鼻毛。