咖啡斑可以治好，一般经过2-6次激光治疗，总体有效率可以达到80%左右，而且越早治疗效果越好。但咖啡斑治疗后容易复发，激光治疗咖啡斑的复发率在5%-50%，与激光治疗类型并没有较大关系。
传统化学剥脱、手术切除、皮肤磨削及液氮冷冻虽然有效，但是不良反应较重，瘢痕形成、色素异常的风险较高，因此目前首选激光治疗，调Q开关激光为治疗咖啡斑首选方法。咖啡斑为表皮黑色素沉积，针对色素作为靶机波长为532nm的调QNd:YAG激光、波长为694nm的调Q红宝石激光、波长为755nm的调Q翠绿宝石激光都可以治疗咖啡斑，但是需要多次治疗。
虽然咖啡斑治疗效果较好，不会引起瘢痕，但是不同咖啡斑疗效差异大，目前没有一种激光能使咖啡斑在治疗后完全不复发。面部咖啡斑对激光治疗更为敏感，治疗半年或者一年内如无复发，则认为治疗效果较好，甚至达到治愈，不会再复发。对于一些边界清楚的咖啡斑，可能治疗效果不好，如果临床上治疗3-4次还没有明显疗效，则不建议继续进行。