怀孕3个月查出甲减，在内科和产科医生的指导下，通过甲状腺药物的摄入进行补充，为时不晚。但是超过3个月，如果甲减的状况持续存在，没有得到有效的甲状腺补充，就会影响胎儿。
甲状腺功能的监测，建议在早孕期间7-8周进行。医学上建议在10周之前，完善孕妇的甲状腺功能监测，一旦发现甲状腺功能低下或者甲状腺功能亢进，要及时在内科大夫的指导下进行治疗。一般建议在7-8周进行检测，10周之内进行确诊，12周左右进行药物的调控。也就是孕妇在3个月，12周左右发现甲减，并且及时给予药物进行补充，对胎儿没有造成影响，还不算晚。
但是在12周以后，甚至16-20周以后，仍然没有给予医学上的甲状腺素补充，甲减的状况延续下去，胎儿就会受到影响，发生流产、先兆流产、胎儿宫内生长受限，或者是胎儿先天性甲状腺功能异常等副反应，所以一定要加以避免。