异位妊娠的治疗方法，需要根据疾病发展程度决定。如果包块不是十分明显，HCG不是很高，可以采取保守治疗办法，注射甲氨蝶呤或服用米非司酮。
如果胚胎比较活跃，HCG＞3000mIU/ml，包块特别大，甚至存在腹腔出血，则必须采取手术治疗。手术有不同的方式，有微创和不微创的。术中需要根据输卵管情况，决定是否保留输卵管，比如输卵管已经发生破裂，包块比较大，剖开输卵管后无法缝合，应进行根治性手术。如果已无对侧输卵管，本侧输卵管的情况允许，剖开取胚之后能够缝合，或者不缝合仍能愈合的情况下，可能会保留本侧输卵管。但是，如果已经达到手术治疗的程度，应切除患侧输卵管，而保留一侧健康输卵管。