嘴唇上起水疱首先分清原因，其次再针对处理，具体如下：
1、单纯疱疹病毒感染：此类最常见，容易反复发作，当人体免疫力下降时会出现。治疗要尽早给予抗病毒药物治疗，如内服阿昔洛韦、伐昔洛韦，外用阿昔洛韦软膏或干扰素凝胶等。通常几天内就能使局部水疱干涸、痊愈，平时还要注意保证良好生活作息，不要熬夜、避免劳累，以免免疫力下降导致疱疹再次复发；
2、局部外伤或虫咬：只要去除病因通常也能很快吸收痊愈，所以不用过于担心。水疱如果破裂后，局部会有比较明显的糜烂面，可适当外用预防感染药物进行治疗，如夫西地酸 乳膏、莫匹罗星软膏等；
3、全身性疾病：需要排除全身性疾病，如手足口病、水痘等，如果确诊，就要进行积极处理，同时还要注意隔离，避免交叉感染他人。