甲硝唑凝胶不能去黑头，因为产生黑头的原因是皮脂分泌物堵塞毛孔后产生破口、发生氧化，加上空气中的灰尘引起黑点。甲硝唑凝胶主要成分是抗细菌的甲硝唑，皮肤表面有葡萄球菌、痤疮杆菌和马拉色菌等，与痤疮感染有关系。
甲硝唑凝胶主要是抗厌氧菌药物，对厌氧菌效果比较好。比如口腔牙齿里面的发酵菌或者厌氧菌感染，会用到甲硝唑，口腔科医生会开甲硝唑片，面部的螨虫也可以用甲硝唑凝胶杀灭。
但黑头不是因为螨虫引起，主要是由于皮脂腺堵塞出现破口，在空气中氧化引起，是皮脂腺堵塞引起的的症状。主要原因不是细菌感染，所以涂甲硝唑凝胶效果不好 。
如果发生黑头，可以用热水洗脸开放毛孔，让里面的分泌物出来；或者到医院用挤压器把粉刺、黑头挤掉，挤掉以后可以涂甲硝唑，但在黑头挤掉以前涂甲硝唑效果不好。