性功能障碍最常见的科室是男科,其次选择泌尿科,再其次选择大外科以及中医内科、中医男科,也可选择心理科。综合性医院有男科的情况下,勃起功能障碍一定要挂男科。如没有男科,可挂泌尿科,若县级医院无泌尿科,只有大外科,就需要挂大外科。中医院、中西医结合医院没有泌尿科,可挂中医男科或中医内科。
特殊的科室也可挂,如焦虑、抑郁或有其它的情绪障碍,同时出现勃起功能障碍,建议挂心理科或精神科,做详细的精神心理方面分析,判断是否因为精神、情绪或心理焦虑、抑郁等心理问题引起勃起障碍。