胃肠间质瘤分为低危、中危、高危，比如直径相对比较小的胃肠间质瘤，如2cm，对于这类型的肿瘤，往往能够手术切除，手术切除之后，通过病理切片的化验，判断处于哪种危险程度。
但是不管是低危、中危、高危，都有复发的几率，只是低危复发几率相对会比较小，中高危复发的几率相对会比较高。
而通过术后的病理切片检查明确之后，可以给予后续的靶向治疗，比如国产的伊马替尼，进口的格列卫或者是二线索尼替尼这类型的药物控制，减少复发。
对于胃肠道间质瘤术后，常规需要复诊，比如每隔3-6个月胃肠镜、腹部CT的检查，当发现胃肠道肿瘤有复发时，会进一步的判断肿瘤是否能够切除，如果是能切除的肿瘤，还是可以考虑再次手术的切除。