脑内许多疾病如脑肿瘤、脑外伤、脑血管意外，都常需要通过头部手术来进行干预。手术治疗因病变的部位不同、脑功能受累程度的轻重不同，采取的方法不一样。但手术治疗原则是解除压迫，缓解颅内压的增高，改善脑血液的循环功能。常见的手术方法：
1、开颅减压：对于脑外伤、颅内出血病人是一种救命的治疗方法；
2、颅内肿瘤的切除：开颅的方法可以根据病变所在的部位不同而采取不同的入路，现代微创医学倾向于脑功能的保护；
3、脑积水的引流或者是转流的手术；
4、脑血管病变：如动脉瘤、脑动静脉畸形等血管性病变的血管内栓塞，或者是手术切除；
5、三叉神经痛、面肌痉挛、原发性高血压的显微血管减压手术；
6、癫痫、运动障碍疾病的病灶切除，以及功能调控，比如DBS手术、迷走神经刺激技术；
7、应用现代的内镜或者是经鼻蝶窦，切除垂体瘤鞍区病变，以及脑内血肿脑积水病变；
8、立体定向手术治疗肿瘤。