酪酸梭菌活菌胶囊主要是用于调节胃肠道的菌群。这个药物在药品说明书中，并没有明确的规定饭前吃还是饭后吃，但是对于微生物制剂，一般建议患者在饭后服用。
主要因为在空腹的情况下，胃酸是酸度比较大的环境，在酸度比较大的环境中，微生态的制剂稳定性或者存活的时间会比较短，饭后食物会中和掉一部分的胃酸，这时服用活菌制剂，能够使活菌制剂更好的发挥调节胃肠道菌群的作用。酪酸梭菌活菌胶囊主要是用于菌群失调所导致的相关疾病，比如可以用于腹泻的患者，也可以用于消化不良的患者，主要是通过调节胃肠道菌群，使胃肠道菌群恢复平衡，来起到治疗的作用。
酪酸梭菌活菌胶囊在使用时需要注意，不能够和抗菌药物同时使用。如果需要联合使用抗菌药物，一定要间隔至少2-3个小时。总之，这个药物属于活菌制剂，建议患者在饭后服用。