长短腿有很多原因，其中一大类是先天性长短腿，即出生以后两个腿不一样长，还有其他原因，比如小时候受过外伤，车祸或者高处坠落，损伤到一侧肢体的骨头，这侧肢体发育比对侧要慢，从而造成长短腿。小时候某侧肢体得过骨髓炎，影响骨骺发育，随着生长发育这侧肢体比对侧短，也会造成长短腿。
有些情况对小儿比较特殊，就是某侧肢体骨干骨折之后，这侧肢体有过度发育现象，不仅与健侧相比不会变短，反而长得比健侧长。这是小儿骨折以后特发的一种现象，叫做骨骼的过度生长。
长短腿的原因有很多，首先要明确什么叫长短腿，其实正常人两个腿也不一样长，总有几毫米的误差，依据教科书所说，两侧绝对值的差＞1.5cm，才定义为需要处理的长短腿。其次要明确长短腿原因，询问有没有骨折、感染过等原因，排除之后才能定义为先天性的长短腿。