幽门螺杆菌治疗，亦经历从药的品种、数量变化的历程。最初时幽门螺杆菌仅需2种药，1周左右绝大部分根除。现在为止，因随幽门螺杆菌治疗人群扩大，导致幽门螺杆菌对这些药物耐药率大大提升。目前主张用4种药物，2周疗法治疗幽门螺杆菌，一般配伍皆是两种抗生素加铋剂，再加质子泵抑制剂，用14天疗法，可使约80%-85%的病人得到根除。
幽门螺杆菌需要专科医生判断是否治疗，以下几种情况是需要治疗：
1、病人有明显症状，胃镜下有胃炎、胃溃疡，甚至胃癌表现；
2、有胃癌家族史，因幽门螺杆菌与胃癌关系较密切；
3、有服用阿司匹林、波立维等药物病史；
4、由于各种情况，需长期用质子泵抑制剂，如奥美拉唑、泮托拉唑等药物；
5、有消化不良症状。
出现上述情况，幽门螺杆菌需要治疗。