女性一般情况下有两个卵巢，左侧和右侧卵巢囊肿没有区别，卵巢囊肿分为两类，生理性囊肿、病理性囊肿。生理性囊肿多与女性月经周期有一定关系，与妊娠状态有关，而病理性囊肿多由各种各样的病理情况引起。
对于生理性囊肿，一般不需要处理，做B超发现一次单纯性囊肿，一般会建议女性2-3个月后，在月经第5-8天复查，生理性囊肿多会自然消失。而对于病理性囊肿，会根据不同情况，根据B超，尤其是彩超报告的情况进行不同处理。卵巢囊肿手术目前大多数是在腔镜下完成，如果有恶性肿瘤的可能，可选用其它不同的方法。对于病理性囊肿，会追加检测卵巢囊肿肿瘤标记物，对卵巢囊肿的良恶性进行初步判断。