大部分口腔发炎是厌氧菌感染，如牙周炎、根尖炎、智齿冠周炎等。所以，口腔使用的抗生素一般都要用到对厌养菌有效的抗生素，如硝基咪唑类的甲硝唑、替硝唑、奥硝唑等。克林霉素也对厌氧菌有效，有时需要两种抗生素协同使用，如既用甲硝唑又用头孢类广谱抗生素。
但口腔发炎不能光靠药物治疗，还应到医院和诊所去仔细检查，了解病根。若需进行补牙，则要补牙，若需洗牙或根管治疗，也需进行。
如智齿炎症消退后应尽早拔掉，不要每次都用消炎药解决，且部分患者还对抗生素过敏。抗生素可能会有一些副作用，一定要在医生的指导下使用，不要自行盲目服用。