消化道肿瘤主要指标是癌胚抗原(CEA)、甲胎蛋白(AFP)、CA199、CA724。具体如下：
1、CEA是一种具有人类胚胎抗原特异性的酸性糖蛋白，常见于胃癌、结直肠癌、肺癌，但良性病变如结肠炎、胰腺炎、肝硬化也可以出现轻度增高；长期吸烟也可以引起CEA轻度增高，因此不具有较强的特异性，需结合症状，胸腹部B超或者CT进行诊断；
2、甲胎蛋白即AFP，是诊断肝细胞肝癌特异性的标志物，AFP是胎儿时期肝脏合成的一种胚胎蛋白，出生以后消除，但当肝细胞恶变后又可以重新获得这一功能；孕妇、新生儿睾丸或者卵巢生殖腺胚胎癌也可以出现AFP增高，部分肝炎、肝硬化，少数消化道肿瘤如胃癌、 结肠癌、胰腺癌等转移性肝癌也可以测得低浓度AFP，所以AFP检测结果必须结合临床情况才能确诊；
3、CA199主要检测胰腺癌，但是此指标的特异性较低，有些胃肠道肿瘤也会轻度增高；如果CA199轻度增高，也不一定是胰腺肿瘤，有些胰腺肿瘤也不一定会引起CA199增高，所以两者不能划等号，但是可以作为胰腺癌复发的敏感指标；
4、CA724是糖类抗原724，此指标特异性较差，多数患者门诊化验单是CA724增高，因为其特异性较差，有时不代表肯定出现胃肠道问题；如果患者不放心，也可以建议患者做进一步胃肠镜检查。