荧光素钠通常对人体没有伤害，常用于OK镜验配，需要使用荧光素染色，另外评估角膜炎症，评估干眼症。配OK镜的镜片是透明地贴在角膜上，但是医生无法用肉眼观察到镜片的松紧程度，所以必须使用裂隙灯上有钴蓝光发出的蓝光进行判断，通过将患者眼球里点滴荧光素，再使用蓝光照射，从而了解镜片的松紧程度。并且荧光素点到眼睛之后，也不用进行冲洗。
评估患者是否出现干眼症的会使用泪膜破裂试验的方法进行评估，即通过钴蓝光，点一滴荧光素钠，在患者眼睛眨眼的过程中，观察泪膜破裂。一般如果超过10秒钟以内都算患者出现干眼的体征，5秒钟之内说明患者有明显干眼的体质。