常规做的是经胸的超声心动图，这是一种无创性的检查方法，所以不痛苦，通常是患者取左侧卧位，充分暴露胸部，在探头涂抹耦合剂，将其聚于患者的胸骨左缘、心尖、剑突下部位，对心脏进行多切面的扫查。因为是无创性的检查，所以小到刚出生的小孩，大到上百岁的老人都可以做超声心动图的检查。如果患者比较瘦，胸部的肋间隙比较小，探头压在胸骨上会有点痛。还有一些女性，比如孕妇、乳腺增生的患者，做超声心动图时会有点痛。部分肺气肿或者是长期吸烟的患者，因肺气较多，医生给患者检查时会增加一点力度，也会感到不舒服。
当从剑突下部位探查心脏时，因上腹部离心脏的位置较远，所以必须要加压探头才能清晰的显示心脏的切面，部分患者可能会觉得不舒服。但剑突下部位又是探查房间隔缺损的最佳位置，通过剑突下的四腔心、双房心切面，不仅可以确诊房间隔缺失，还可以根据断端与上下腔静脉之间有无残余的房间隔组织，决定手术治疗的方式，是介入治疗还是经胸的开刀手术治疗。部分患者对于疼痛可能会比较敏感，当医生在剑突下部位加压探头时，患者的腹肌会出现紧张的状态，腹肌会比较硬，抵压医生的探头，这样患者就会更加痛苦。所以检查时身心放松，就不会感觉到痛苦。