若孩子的口腔内出现疱疹，较常见的是疱疹性口腔炎，主要是由单纯疱疹病毒1型感染所引起，孩子的疱疹主要在口腔黏膜。另外，还有些孩子可能会在口腔内、咽部出现疱疹，即疱疹性咽峡炎，其实也是病毒感染，主要是由A组柯萨奇病毒感染所引起。
无论是疱疹性口腔炎还是疱疹性咽峡炎，从本质上来讲孩子口腔内长疱疹主要都是由病毒感染所引起。因此在用药方面不太需要给孩子使用特别的抗病毒药，等待自然病程即可。一般依靠孩子自身抵抗力，自然病程在1周左右，病毒感染会逐渐自行恢复。
当然有些孩子在病毒感染的中后期继发细菌感染，这时若有证据证明其已经继发细菌感染，则可考虑给孩子使用抗生素来帮助症状缓解。
除此之外，就是针对孩子口腔疱疹产生的相关症状所做的处理或所吃的药。比如孩子有口腔疱疹时往往都会有高热或发热，在他体温较高、不舒服的情况下可使用退烧药，比如对乙酰氨基酚或布洛芬。
另外，很多孩子可能会出现咽部疼痛，对稍微大点的孩子可使用口喷剂或含片来帮助缓解症状。稍微小点的孩子主要是多喝水、注意休息，等待自然病程即可。