肾结石的发病原因并非肾功能不全，但是肾结石可以导致肾功能不全。肾结石的发病原因较为复杂，目前没有完全明确，但与患者饮水量、遗传因素、人种、地域、工作性质以及自身代谢情况密切相关。
肾结石发生后在肾中会逐渐长大或逐渐变多，如果一旦堵塞肾盂输尿管连接部会引起肾积水。肾积水若短期之内能够解除，肾脏可以重新恢复工作，患者的肾功能一般不会受到影响；但是若肾积水时间过长，肾脏会发生不可逆的损害从而导致肾功能不全。
一般一侧肾积水会影响本侧肾脏，如果出现两侧肾积水，则会导致血液中代谢产物的水平增加，出现血尿素氮、肌酐急剧升高，此时患者需要进行紧急处理。