一般儿童原发性肾病综合征90%以上是微小病变，不像成人肾病综合征病理多变，通常需要经过肾穿刺确定诊断后才能治疗。儿童原发性肾病综合征可不需肾活检，直接根据微小病变病理类型开始经验性治疗。大约5%的患儿会在肾病综合征发病后1-2周自行恢复，具体原因仍不清楚。如果症状不是很重，推迟几天或者观察1周再开始治疗也可。
儿童肾病综合征激素起效时间比成人快，成人肾病综合征激素起效时间常需等到16周，但儿童在使用足量激素的4周以内，90%患者都会完全缓解，剩下通常也会在8周内缓解。激素起效越快，预后越好，少于7天缓解，激素依赖可能性相对比较低。 如果激素治疗8周仍然没有反应的患儿被视为激素耐药性，需做肾活检明确是否有其它肾小球疾病，如局灶节段性硬化。