过敏性咽炎患者咳嗽可以适当使用抗过敏药物，如氯雷他定或者依巴斯汀等抗组胺药物。若效果不佳，可加用口服白三烯受体拮抗剂，如孟鲁司特，一般连续治疗1-2周就可以获得比较好的效果。过敏通常会合并鼻痒、流清鼻涕、打喷嚏等症状，口服抗过敏药会同期、同步缓解鼻炎的症状。
若咳嗽症状持续不好，尤其在使用抗过敏药后仍然无法缓解，要考虑与胃酸反流造成的反流性食管炎及反流性咽喉炎有关。因患者难以自觉反酸，由于胃酸反流刺激造成的咳嗽、咽喉不适症状，无法得到及时有效地治疗，导致病情持续数年甚至数十年不愈。
若抗过敏治疗无确切疗效，需要考虑胃酸胃液反流刺激导致反流性咽喉炎的可能性，必要时使用抑制胃酸的药物治疗，以取得好的疗效。