CEA和CA199均是临床上作为癌症筛查的血清学肿瘤标志物，两者所代表的肿瘤或者临床意义不完全相同，难以对比两者的准确性。如果从特异性而言，CA199主要是见于消化系统肿瘤，比如大肠癌、胰腺等，特异性可能相对更高。而癌胚抗原CEA与体内多个器官系统的肿瘤发生可能都有一定相关性，特异性相对更低。CEA可以见于消化系统肿瘤，比如胃癌、肠癌、胰腺癌、胆道癌等，也可以见于其他系统的肿瘤，包括女性的乳腺癌、卵巢癌等。
临床通常不会通过单个指标判断是否存在肿瘤以及肿瘤的类型，如果CEA和CA199出现升高，还需结合相关影像学检 查、病人临床表现等进行诊断。影像学检查有助于判断机体内是否存在肿瘤，而一旦发现肿瘤，应及早完善病理诊断进行定性，从而指导后续的治疗。