一般怀孕前3个月易发生自然流产，自然流产指未经人为干预而发生，相对人工流产而言。自然流产原因有胚胎因素、母体因素、父亲因素和环境因素等，其中胚胎因素多见。由于精子或卵子染色体异常，或精子和卵子形成受精卵后，受精卵在分裂过程中出现染色体变异，而导致自然流产。另外，母体内分泌异常亦可导致自然流产，亦有可能孕妇情绪不稳定、生活不规律、剧烈运动或腹部受撞击等外在因素而导致自然流产。
由于前3个月内胚胎还没有形成，此时胚胎不稳定，易出现先兆流产或发生自然流产，所以怀孕后需注意避免性生活及剧烈运动， 一般怀孕6周行B超检查，从而证明是宫内孕还是宫外孕。怀孕9-10周再次行B超检查，观察胚胎发育情况及胎心、胎芽，从而发现胎停育(胎儿停育)。若出现腹痛或阴道出血，需随时到医院检查处理。