细菌感染和病毒感染可从以下方面进行区别：
1、病变性质：细菌和病毒均可引起上呼吸道感染，但细菌引起的病变主要以化脓为主，可引起扁桃体红肿、有脓点。但病毒感染一般是非化脓性病变，亦可引起扁桃体的红、肿，但一般不会出现脓点；
2、化验结果：细菌感染时常有白细胞、中性粒细胞升高，同时降钙素原(PCT)会明显升高。而病毒感染白细胞常在正常水平甚至下降，PCT(降钙素原)可轻度升高，但多数均为正常。病原学检查是诊断细菌感染和病毒感染的金标准，若为细菌感染，从感染部位取材或做血培养可培养出细菌，而病毒感染的细菌培养为阴性。病毒感染的患者可通过检测病毒的核酸，以及病毒的特异性IgM、IgG抗体来进行诊断；
3、治疗方法：病毒感染用抗生素治疗无效，细菌感染则需用抗生素进行治疗，经过抗生素治疗，炎症可以得到控制，发烧等症状可缓解。