非细菌性膀胱炎的治疗与疾病类型有关，常见于以下几种情况：
1、结核性膀胱炎：标准的治疗是抗结核，可能有三联、四联的抗痨治疗，等到患者的结核控制比较稳定，膀胱如果出现挛缩，可能需要进行膀胱扩大的手术；
2、间质性膀胱炎：患者需进行对症治疗，使用止疼药镇痛，也需使用阿米替林、肉毒素，或者M受体阻滞剂，比如托特罗定。另外，患者还可使用环孢素，以及膀胱可以灌注的药物，比如西施泰、辣椒辣素等；
3、其他类型膀胱炎：包括腺性膀胱炎，如果怀疑有肿瘤的风险，患者还需要手术治疗。如果是放射性膀胱炎，则可以对症地使用止血、止痛药物，甚至使用高压氧舱进行治疗。