下丘脑垂体失调主要针对病因进行治疗，如果是基因突变和遗传因素引起的下丘脑垂体功能低减，一般可以靶腺激素替代治疗或者下丘脑激素治疗。如果是肿瘤所致，比如生殖细胞瘤和松果体瘤，采用放疗比较好。如果是泌乳素瘤，患者可以采用口服药物，比如多巴胺受体激动剂、溴隐亭效果比较好，部分垂体瘤患者可能只能采取手术治疗。
下丘脑垂体失调患者在临床上可以有多种多样的临床表现，比如体温调节障碍，患者可以出现无其它原因的体温增高或者体温过低，也可以出现摄食异常，比如贪吃、没有饱腹感，患者可能一直在吃，体重不断增加；或者厌食，患者不吃东西，体重明显减少；甚至可以影响到患者生长发育和生殖功能异常，会严重影响患者生存质量和生存期。